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面對乾旱，經濟部長王美花曾稱未來規畫在新竹設長期海水淡化廠，日產10萬噸海淡水，並傳可能專管專供竹科。此話讓地方很傻眼，擔心海淡廠的高鹽度鹵水，破壞海洋生態將甚於三接！

由於持續乾旱，水利署在南寮增設海淡處理模組，可日供1.3萬噸海淡水，並傳出準備擴大為日產10萬噸，設專管供應給竹科，讓地方人士很錯愕，陳炳煌直言，海淡水能不能給園區廠商用，「問台積電就知道！」

北區水資源局澄清，若建成會將海淡水送新竹淨水廠做整體調度運用，因海淡水要價高，會趨向輔助水源，目前還在準備環評階段。

新竹市議會議長許修睿則直指海淡廠淡化海水會產生高鹽度鹵水，排到海裡破壞海洋生態，可能比三接破壞藻礁還大，但政府大內宣讓民眾感覺海淡廠似成解決缺水靈丹之一，「若沒有鹵水問題，何不全省都蓋海淡廠？」

不過，學者則有不同看法，陽明交通大學環境工程研究所講座教授黃志彬說，海水含硼是特殊現象，是天然物質並非汙染物，目前國外已有可濾掉硼的特殊RO膜材，或採用兩段式一般RO膜，對硼也具有較高去除效果，因此海淡水中含硼，將不會再是關切議題，「海淡水含硼不利晶圓製程是假議題」。

至於海水淡化後產生的鹵水鹽度高，可能破壞海洋生態問題，黃志彬也指出，鹵水含的氯化鈉不是汙染物，環保署沒有針對此項目訂定排放標準。他認為鹵水若採用多孔式高壓排放，用放射狀並非單點的排放，會被稀釋掉並融入海水裡。